植物DNA的提取和純化是植物基因工程研究的基礎操作。實施分子標記、基因圖譜、基因指紋圖譜、基因文庫構建、遺傳多態性分析、DNA重組、RAPD（隨機引物多態性DNA）、RFLP（限制性酶多態性）、基因分離及遺傳轉化和鑒定等都以提取DNA為前提。
目前，對從植物組織中提取DNA方法的要求是：簡便、有效、快捷以及經濟。與動物組織相比，植物組織含有較多的多糖和其他次生代謝產物（酚、酯、萜、色素等），這給高質量的DNA提取帶來較多的困難。尤其是多糖成分是影響DNA純度最常見的問題。如何做到既去除這些污染物又能相對保持高的產量，并且能簡捷有效地提純，一直是植物生物技術研究者探索的問題。
01
普通的植物
對于普通的植物（低酚、低酯、低糖等）如：水稻、白菜、莧菜、南瓜、黃瓜、西紅柿、上海青、菠菜、筍瓜、冬瓜、蓮藕、山藥、竹筍等；我們可以選用普通植物DNA提取試劑盒（磁珠法）試劑（貨號：K318）。
02
多糖、多酚類植物
對于多糖、多酚類植物（香蕉、西瓜、蘋果、梨等果肉，紅薯、馬鈴薯等塊莖，棉花、月季、枇杷、益母草、夏枯草等人參、曼陀羅、向天果、射干、桔梗、滿山紅、金雞納霜等藥用植物）可以選用多酚植物DNA提取試劑盒（磁珠法）試劑（貨號K319），針對類似的植物我們經過長期的優化，可以得到較好的實驗結果。
以葉片為例，葉片需先剪碎成小塊，以便放入1.5ml離心管。最佳樣本的長度應在1cm 以下。重量不超過250mg，推薦使用50mg，如果是植物種子粉末可以使用10mg-20mg粉末即可。
葉子
莖
根
樣本數量較少的情況下：可以使用手持式（寶予德）研磨儀，將植物的組織切碎后放入1.5ml 尖底離心管中，將研磨棒的頭部碾壓植物組織，打開研磨儀的開關，直至肉眼看到植物組織研磨成碎末。
樣本數量較多的情況下：可以使用HF Extract組織研磨儀 可以同時處理2-192個樣品（需配不同適配器）。將植物的組織切碎后放入2ml的研磨管中，加入鋼珠或二氧化鋯珠8-16顆（根據試劑情況靈活選擇），按照如下方案編輯研磨程序：
對于莖部纖維化比較嚴重的組織或者根部樣本，要配合液氮處理（將植物組織用剪刀剪切<0.5cm，放入研磨管中），使用配套的冷凍研磨套件（如下圖），將研磨罐中灌入液氮冷凍植物樣品，等液氮揮發后，快速擰好研磨罐放入研磨儀。執行程序：
打開研磨后的管子（預先6000rpm離心30sec防止管子上的碎片或碎末飛出，污染實驗室），加入裂解液APL（需要預熱）400-600 μl，放入水浴鍋中孵育30 min-1 h。
孵育后，12000 rpm 離心3min，取上清100μl-200μl 上清（含淀粉多的樣品容易糊化，可以增加離心時間至5-10min）
96孔預分裝板
加入預分裝96孔板中的第1、7列，然后放入核酸提取儀中（如下圖），插好磁棒套。點擊運行程序。
20min后，完成DNA的提取。轉移5、11列中的DNA 至1.5ml離心管中，使用超微量分光度計（Mcro-Drop ）檢測核酸濃度：
記錄檢測結果，進入下步擴增或將DNA保存至-20℃。
